<html><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">Hello Eh,<div><br><div>That's easier than I expected...&nbsp;</div><div>I also had to move the line in my input file from under the [CitcomS.solver.ic] to [CitcomS.solver.bc] (aha!)</div><div>and it works!&nbsp;</div><div><br></div><div>I think I'm finally starting to understand how the pyre pieces fit together with the C program and the input file...</div><div><br></div><div>Thank you,<br><div>Magali</div></div><div><br></div><div><div>On Jun 22, 2010, at 7:15 PM, Eh Tan wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"> <div bgcolor="#ffffff" text="#000000"> Hi Magali,<br> <br> You also need to add your input parameter on the python side, in CitcomS/Components/BC.py.<br> <br> Eh<br> <br> <br> On 6/23/10 6:46 AM, Magali Billen wrote: <blockquote cite="mid:D99F7239-A368-4B2F-9A16-38BE658E2ECA@ucdavis.edu" type="cite">Hello,  <div><br>  </div>  <div>I have a question about a parameter that can be read from the input file in the standard version of CitcomS,</div>  <div>but is not recognized in the pyre version. I'd like to know what changes to make so that it gets read in.&nbsp;</div>  <div><br>  </div>  <div>This is actually a more&nbsp;general question than just this one variable, as I'd like to make some other modifications to CitcomS, which</div>  <div>require creating a few new parameters that need to get read in and I'd like to use nested solvers, so I need to&nbsp;learn how to do this for the pyre version.</div>  <div><br>  </div>  <div>Here are the details:</div>  <div>I'd like to use the variable E-&gt;convection.blob_bc_persist which exists in the non pyre version of CitcomS:</div>  <div>  <div><br>  </div>  <div><font class="Apple-style-span" face="Courier">[java:CitcomS/CitcomS-3.1.1/lib] billen% grep blob_bc_persist *.c</font></div>  <div><font class="Apple-style-span" face="Courier">Initial_temperature.c: &nbsp; &nbsp; &nbsp;input_boolean("blob_bc_persist",&amp;(E-&gt;convection.blob_bc_persist),"off",m);</font></div>  <div><font class="Apple-style-span" face="Courier">Initial_temperature.c:</font><span class="Apple-tab-span" style="white-space: pre;"><font class="Apple-style-span" face="Courier"> </font></span><font class="Apple-style-span" face="Courier">&nbsp;&nbsp; &nbsp; &nbsp; if(E-&gt;convection.blob_bc_persist){</font></div>  </div>  <div><br>  </div>  <div>but does not have a binding</div>  <div><br>  </div>  <div>  <div><font class="Apple-style-span" face="Courier">[java:CitcomS/CitcomS-3.1.1/module] billen% grep blob_bc_persist *.c</font></div>  </div>  <div><br>  </div>  <div>The other blob related variables are listed in setProperties.c</div>  <div><br>  </div>  <div>  <div><font class="Apple-style-span" face="Courier">[java:CitcomS/CitcomS-3.1.1/module] billen% grep blob *.c</font></div>  <div><font class="Apple-style-span" face="Courier">setProperties.c: &nbsp; &nbsp;getFloatVectorProperty(properties, "blob_center", E-&gt;convection.blob_center, 3, fp);</font></div>  <div><font class="Apple-style-span" face="Courier">setProperties.c: &nbsp; &nbsp;if( E-&gt;convection.blob_center[0] == -999.0 &amp;&amp; E-&gt;convection.blob_center[1] == -999.0 &amp;&amp; E-&gt;convection.blob_center[2] == -999.0 ) {</font></div>  <div><font class="Apple-style-span" face="Courier">setProperties.c: &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;E-&gt;convection.blob_center[0] = 0.5*(E-&gt;control.theta_min+E-&gt;control.theta_max);</font></div>  <div><font class="Apple-style-span" face="Courier">setProperties.c: &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;E-&gt;convection.blob_center[1] = 0.5*(E-&gt;control.fi_min+E-&gt;control.fi_max);</font></div>  <div><font class="Apple-style-span" face="Courier">setProperties.c: &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;E-&gt;convection.blob_center[2] = 0.5*(E-&gt;sphere.ri+E-&gt;sphere.ro);</font></div>  <div><font class="Apple-style-span" face="Courier">setProperties.c: &nbsp; &nbsp;getFloatProperty(properties, "blob_radius", E-&gt;convection.blob_radius, fp);</font></div>  <div><font class="Apple-style-span" face="Courier">setProperties.c: &nbsp; &nbsp;getFloatProperty(properties, "blob_dT", E-&gt;convection.blob_dT, fp);</font></div>  </div>  <div><br>  </div>  <div>So, I added the following line to setProperties.c</div>  <div><br>  </div>  <div><font class="Apple-style-span" face="Courier">getIntProperty(properties, "blob_bc_persist", E-&gt;convection.blob_bc_persist, fp);</font></div>  <div><br>  </div>  <div>re-ran make (it did recompile/link setProperties), and then reran my model,&nbsp;but I still get the following error:</div>  <div><br>  </div>  <div>  <div><font class="Apple-style-span" face="Courier">&gt;&gt; inplume1.cfg:39:</font></div>  <div><font class="Apple-style-span" face="Courier">&nbsp;-- pyre.inventory(error)</font></div>  <div><font class="Apple-style-span" face="Courier">&nbsp;-- regional.ic.blob_bc_persist &lt;- '1'</font></div>  <div><font class="Apple-style-span" face="Courier">&nbsp;-- unrecognized property 'regional.ic.blob_bc_persist'</font></div>  <div><font class="Apple-style-span" face="Courier">usage: citcoms [--&lt;property&gt;=&lt;value&gt;] [--&lt;facility&gt;.&lt;property&gt;=&lt;value&gt;] [FILE.cfg] ...</font></div>  <div><font class="Apple-style-span" face="Courier">component 'CitcomS'</font></div>  <div><font class="Apple-style-span" face="Courier">&nbsp;&nbsp; &nbsp;properties: controller, help, help-components, help-persistence, help-properties, job, launcher, nodes, sc</font></div>  <div><font class="Apple-style-span" face="Courier">heduler, solver, steps, typos, weaver</font></div>  <div><font class="Apple-style-span" face="Courier">&nbsp;&nbsp; &nbsp;facilities: controller,job,launcher,scheduler,solver,weaver</font></div>  <div><font class="Apple-style-span" face="Courier">For more information:</font></div>  <div><font class="Apple-style-span" face="Courier">&nbsp;&nbsp;--help-properties: prints details about user settable properties</font></div>  <div><font class="Apple-style-span" face="Courier">&nbsp;&nbsp;--help-components: prints details about user settable facilities and components</font></div>  <div><font class="Apple-style-span" face="Courier">CitcomS: configuration error(s)</font></div>  </div>  <div><br>  </div>  <div>Can you tell me what else I have to do to make this get read in by the Pyre version?</div>  <div><br>  </div>  <div>Thanks,</div>  <div>Magali</div>  <div><br>  </div>  <pre wrap=""><fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset>
_______________________________________________
CIG-MC mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:CIG-MC@geodynamics.org">CIG-MC@geodynamics.org</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://geodynamics.org/cgi-bin/mailman/listinfo/cig-mc">http://geodynamics.org/cgi-bin/mailman/listinfo/cig-mc</a>
  </pre> </blockquote> <br> </div> </blockquote></div><br></div></body></html>