On Tue, May 22, 2012 at 11:44 PM, Charles Williams <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:willic3@gmail.com" target="_blank">willic3@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div style="word-wrap:break-word">What version of PyLith are you running?  I&#39;m running the prerelease version of 1.7 and I also get a problem when I try running on more than 1 node in examples/3d/hex8; however, the problem seems to go away when I try a different linear solution option.  Try using the attached .cfg file and see if things improve.  For your particular problem, I get a different issue when running in parallel (HDF5 error).  I&#39;m not sure what the problem might be, but we&#39;ll have a look.</div>
</blockquote><div><br></div><div>Can someone post the error?</div><div><br></div><div>  Thanks,</div><div><br></div><div>     Matt</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div style="word-wrap:break-word"><div>Cheers,</div><div>Charles</div><div><br></div><div></div><span style="white-space:pre-wrap">[see attached file: pc_fieldsplit_mult_separate.cfg]</span><div style="word-wrap:break-word">
<div></div><div><br><div><div><div class="h5"><div>On 23/05/2012, at 1:36 PM, Romain Jolivet wrote:</div><br></div></div><blockquote type="cite"><div><div><div class="h5">Hi, <br><br>I have a problem running pylith on multiple nodes. <br>
<br>My model is based on an elastic medium with a fault in it. When I use the FaultCohesiveKin property and impose the displacement, everything is fine.<br>However, when I use the FaultCohesiveDyn property, with StaticFriction, it starts getting messy. My files are attached.<br>
I run:<br>pylith step01.cfg<br>and the run is fine<br>If I run<br>pylith --nodes=10 step01.cfg<br>it crashes at the first time step. I tried with nodes=2 to nodes=12 (the number of cores on my machine) and I had the same result. The error message comes from petsc.<br>
<br>I went into the pylith examples to find a similar, but simpler, problem. In example/3d/hex8/, I tried to run step10.cfg:<br>with one node, it is fine:<br>pyltih step10.cfg<br>However, when you ask for several nodes (more than 2), it crashes:<br>
pylith --nodes=3 step10.cfg<br>with 2 nodes, it seems to be fine, but you have a petsc error message at the end.<br><br>I someone has an idea on this....<br>Thank you<br>Romain<br><br></div></div><span>&lt;TestRomain.tgz&gt;</span><br>
<br><br><br>Romain Jolivet<br>Postdoctoral Scholar<br>Geological and Planetary Sciences<br>California Institute of Technology, Pasadena, CA <br><a href="mailto:rjolivet@caltech.edu" target="_blank">rjolivet@caltech.edu</a><br>
<a href="tel:%2B1%20%28626%29%20560%206356" value="+16265606356" target="_blank">+1 (626) 560 6356</a><br><br>_______________________________________________<br>CIG-SHORT mailing list<br><a href="mailto:CIG-SHORT@geodynamics.org" target="_blank">CIG-SHORT@geodynamics.org</a><br>
<a href="http://geodynamics.org/cgi-bin/mailman/listinfo/cig-short" target="_blank">http://geodynamics.org/cgi-bin/mailman/listinfo/cig-short</a><br></div></blockquote></div><br><div>
<span style="font-size:12px"><div style="word-wrap:break-word"><div><div style="margin-top:0px;margin-right:0px;margin-bottom:0px;margin-left:0px"><font face="Helvetica" size="3" style="font:normal normal normal 12px/normal Helvetica">Charles A. Williams</font></div>
<div style="margin-top:0px;margin-right:0px;margin-bottom:0px;margin-left:0px">Scientist<br>GNS Science<br>1 Fairway Drive, Avalon<br>PO Box 30368<br>Lower Hutt  5040<br>New Zealand<br>ph (office): 0064-4570-4566<br>fax (office): 0064-4570-4600</div>
<div style="margin-top:0px;margin-right:0px;margin-bottom:0px;margin-left:0px"><a href="mailto:C.Williams@gns.cri.nz" target="_blank">C.Williams@gns.cri.nz</a></div></div></div></span>
</div>
<br></div></div></div><br>_______________________________________________<br>
CIG-SHORT mailing list<br>
<a href="mailto:CIG-SHORT@geodynamics.org">CIG-SHORT@geodynamics.org</a><br>
<a href="http://geodynamics.org/cgi-bin/mailman/listinfo/cig-short" target="_blank">http://geodynamics.org/cgi-bin/mailman/listinfo/cig-short</a><br>
<br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>
-- Norbert Wiener<br>